داستان فیلم در مورد یک مامور پلیس به اسم وتر است. او در مرزهای جنوبی امریکا بدنبال یکی از بزرگترین و بیرحم ترین قاچاقچیان مواد مخدر است به اسم لوکرو است. وتر عاقبت موفق می شود او را دستگیر کند و لوکرو به حبس ابد محکوم می شود اما قسم می خورد که روزی از وتر انتقام بگیرد…

اوایل قرن بیستم. میلو تاچ زبان شناسی است که تصمیم گرفته جست و جوهای پدربزرگش را برای پیدا کردن امپراتوری از دست رفته و غرق شده ی آتلانتیس ادامه دهد. میلیونری به نام پرستن ویتمور، میلو را استخدام می کند و او نیز به گروهی ماجراجو می پیوندد که سرپرست شان، رورک، فرمانده یک زیردریایی است…

پس از وقایع قسمت اول، مایلو و کیدا بار دیگر با یکدیگر ملاقات می کنند. آنها پس از انجام یک سری از تحقیقات اولیه متوجه وقایع غیر طبیعی میشوند به طوری به جزیره اسرار آمیز آتلانتیس ارتباط دارد. آنها باید پرده از این اسرار شوم بردارند…